Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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