Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms