Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms