Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms