Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms