Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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