Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB9BQ9NP90 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms