Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CEP44Q9C0F1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CEP44Q9C0F1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CEP44Q9C0F1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CEP44Q9C0F1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CEP44Q9C0F1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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