Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHACTR1Q9C0D0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms