Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA4CQ9C0C4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA4CQ9C0C4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA4CQ9C0C4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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