Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms