Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CNPPD1Q9BV87 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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