Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms