Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPOCK3Q9BQ16 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPOCK3Q9BQ16 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPOCK3Q9BQ16 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPOCK3Q9BQ16 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPOCK3Q9BQ16 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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