Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms