Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN18Q96SJ8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms