Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms