Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms