Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms