Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms