Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms