Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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