Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM35BQ8NCS4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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