Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms