Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms