Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms