Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms