Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL22Q53GT1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms