Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms