Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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