Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CDSNQ15517 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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