Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms