Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DDX39BQ13838 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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