Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL4AQ13619 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL4AQ13619 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4AQ13619 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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