Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms