Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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SGCGQ13326 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SGCGQ13326 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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