Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CLN3Q13286 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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