Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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