Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms