Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms