Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASP9P55211 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASP9P55211 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms