Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATMP50440 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATMP50440 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATMP50440 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATMP50440 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms