Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNTBP49356 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNTBP49356 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms