Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms