Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms