Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms