Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms