Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms