Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF5P43026 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF5P43026 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms