Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms